Multislajsni skener se koristi u cilju otkrivanja uzroka glavobolje, vrtoglavice, u cilju procene povreda glave ili u cilju otkrivanja aneurizme, krvarenja, šloga ili tumora na mozgu. U hitnim slučajevima MSCT dijagnostika ima značajnu ulogu u brzom otkrivanju povreda i krvarenja u mozgu. Cela procedura je potpuno bezbolna.
